RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.41■■■□□ 2.62
GINS1-204ENST00000484893 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.77■■■□□ 2.04
GINS1-204ENST00000484893 ABCC9O60706 1549 aa26.9■■□□□ 1.9
GINS1-204ENST00000484893 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GINS1-204ENST00000484893 NACADO15069 1562 aa26.03■■□□□ 1.76
GINS1-204ENST00000484893 MYO15BQ96JP2 1530 aa26■■□□□ 1.75
GINS1-204ENST00000484893 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26■■□□□ 1.75
GINS1-204ENST00000484893 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.98■■□□□ 1.75
GINS1-204ENST00000484893 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.96■■□□□ 1.75
GINS1-204ENST00000484893 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.51■■□□□ 1.67
GINS1-204ENST00000484893 SCRIBQ14160 1630 aa25.34■■□□□ 1.65
GINS1-204ENST00000484893 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.31■■□□□ 1.64
GINS1-204ENST00000484893 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
GINS1-204ENST00000484893 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.93■■□□□ 1.58
GINS1-204ENST00000484893 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.57■■□□□ 1.52
GINS1-204ENST00000484893 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GINS1-204ENST00000484893 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.48■■□□□ 1.51
GINS1-204ENST00000484893 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.37■■□□□ 1.49
GINS1-204ENST00000484893 SMARCA4P51532 1647 aa24.3■■□□□ 1.48
GINS1-204ENST00000484893 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GINS1-204ENST00000484893 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.24■■□□□ 1.47
GINS1-204ENST00000484893 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.11■■□□□ 1.45
GINS1-204ENST00000484893 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.09■■□□□ 1.45
GINS1-204ENST00000484893 NCAPD3P42695 1498 aa24.06■■□□□ 1.44
GINS1-204ENST00000484893 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GINS1-204ENST00000484893 SMARCA2P51531 1590 aa24.03■■□□□ 1.44
GINS1-204ENST00000484893 WIZO95785 1651 aa23.98■■□□□ 1.43
GINS1-204ENST00000484893 HMGXB3Q12766 1538 aa23.94■■□□□ 1.42
GINS1-204ENST00000484893 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
GINS1-204ENST00000484893 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GINS1-204ENST00000484893 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
GINS1-204ENST00000484893 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.45■■□□□ 1.34
GINS1-204ENST00000484893 NESP48681 1621 aa23.41■■□□□ 1.34
GINS1-204ENST00000484893 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.34■■□□□ 1.33
GINS1-204ENST00000484893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.32■■□□□ 1.32
GINS1-204ENST00000484893 CFTRP13569 1480 aa23.29■■□□□ 1.32
GINS1-204ENST00000484893 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.13■■□□□ 1.29
GINS1-204ENST00000484893 PRDM2Q13029 1718 aa23.12■■□□□ 1.29
GINS1-204ENST00000484893 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.12■■□□□ 1.29
GINS1-204ENST00000484893 ERCC6Q03468 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
GINS1-204ENST00000484893 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.05■■□□□ 1.28
GINS1-204ENST00000484893 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GINS1-204ENST00000484893 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.97■■□□□ 1.27
GINS1-204ENST00000484893 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.91■■□□□ 1.26
GINS1-204ENST00000484893 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
GINS1-204ENST00000484893 WDR62O43379 1518 aa22.85■■□□□ 1.25
GINS1-204ENST00000484893 CUX2O14529 1486 aa22.79■■□□□ 1.24
GINS1-204ENST00000484893 TOPBP1Q92547 1522 aa22.75■■□□□ 1.23
GINS1-204ENST00000484893 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
GINS1-204ENST00000484893 CUX1P39880 1505 aa22.72■■□□□ 1.23
GINS1-204ENST00000484893 ABCC8Q09428 1581 aa22.69■■□□□ 1.22
GINS1-204ENST00000484893 SYNJ1O43426 1573 aa22.59■■□□□ 1.21
GINS1-204ENST00000484893 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
GINS1-204ENST00000484893 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GINS1-204ENST00000484893 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.57■■□□□ 1.2
GINS1-204ENST00000484893 TOP2BQ02880 1626 aa22.56■■□□□ 1.2
GINS1-204ENST00000484893 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.54■■□□□ 1.2
GINS1-204ENST00000484893 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GINS1-204ENST00000484893 IFT140Q96RY7 1462 aa22.48■■□□□ 1.19
GINS1-204ENST00000484893 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.48■■□□□ 1.19
GINS1-204ENST00000484893 SOGA1O94964 1423 aa22.45■■□□□ 1.18
GINS1-204ENST00000484893 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GINS1-204ENST00000484893 WDR97A6NE52 1622 aa22.4■■□□□ 1.18
GINS1-204ENST00000484893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.35■■□□□ 1.17
GINS1-204ENST00000484893 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
GINS1-204ENST00000484893 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GINS1-204ENST00000484893 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GINS1-204ENST00000484893 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.25■■□□□ 1.15
GINS1-204ENST00000484893 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.22■■□□□ 1.15
GINS1-204ENST00000484893 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.2■■□□□ 1.14
GINS1-204ENST00000484893 TRIM41Q8WV44 630 aa22.19■■□□□ 1.14
GINS1-204ENST00000484893 PBRM1Q86U86 1689 aa22.15■■□□□ 1.14
GINS1-204ENST00000484893 GRIN2BQ13224 1484 aa22.15■■□□□ 1.14
GINS1-204ENST00000484893 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.09■■□□□ 1.13
GINS1-204ENST00000484893 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.09■■□□□ 1.13
GINS1-204ENST00000484893 KIF27Q86VH2 1401 aa22.07■■□□□ 1.12
GINS1-204ENST00000484893 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.06■■□□□ 1.12
GINS1-204ENST00000484893 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GINS1-204ENST00000484893 IGF1RP08069 1367 aa22.04■■□□□ 1.12
GINS1-204ENST00000484893 CHD1O14646 1710 aa22■■□□□ 1.11
GINS1-204ENST00000484893 ADAMTS12P58397 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
GINS1-204ENST00000484893 SYNJ2O15056 1496 aa21.97■■□□□ 1.11
GINS1-204ENST00000484893 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.94■■□□□ 1.1
GINS1-204ENST00000484893 CUL7Q14999 1698 aa21.89■■□□□ 1.1
GINS1-204ENST00000484893 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GINS1-204ENST00000484893 GRIN2AQ12879 1464 aa21.88■■□□□ 1.09
GINS1-204ENST00000484893 FBLN2P98095 1184 aa21.87■■□□□ 1.09
GINS1-204ENST00000484893 OSCARQ8IYS5 282 aa21.87■■□□□ 1.09
GINS1-204ENST00000484893 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.87■■□□□ 1.09
GINS1-204ENST00000484893 EEA1Q15075 1411 aa21.82■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.82■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 NUP160Q12769 1436 aa21.81■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 PRXQ9BXM0 1461 aa21.81■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 CEP170Q5SW79 1584 aa21.8■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.79■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.79■■□□□ 1.08
GINS1-204ENST00000484893 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.75■■□□□ 1.07
GINS1-204ENST00000484893 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GINS1-204ENST00000484893 KIF21BO75037 1637 aa21.64■■□□□ 1.05
GINS1-204ENST00000484893 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms