RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497668.1

RAPGEF5-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

TSL 3

Gene RAPGEF5, Length 383 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5-211ENST00000497668 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.81■■■■■ 4.76
RAPGEF5-211ENST00000497668 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF5-211ENST00000497668 ABCC9O60706 1549 aa40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF5-211ENST00000497668 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.4■■■■□ 3.74
RAPGEF5-211ENST00000497668 NACADO15069 1562 aa38.13■■■■□ 3.69
RAPGEF5-211ENST00000497668 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.06■■■■□ 3.68
RAPGEF5-211ENST00000497668 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.69■■■■□ 3.62
RAPGEF5-211ENST00000497668 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.64■■■■□ 3.62
RAPGEF5-211ENST00000497668 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.51■■■■□ 3.6
RAPGEF5-211ENST00000497668 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF5-211ENST00000497668 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF5-211ENST00000497668 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
RAPGEF5-211ENST00000497668 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.08■■■■□ 3.53
RAPGEF5-211ENST00000497668 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.88■■■■□ 3.49
RAPGEF5-211ENST00000497668 SCRIBQ14160 1630 aa36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF5-211ENST00000497668 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF5-211ENST00000497668 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
RAPGEF5-211ENST00000497668 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.39■■■■□ 3.42
RAPGEF5-211ENST00000497668 NCAPD3P42695 1498 aa35.21■■■■□ 3.23
RAPGEF5-211ENST00000497668 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.06■■■■□ 3.2
RAPGEF5-211ENST00000497668 SMARCA4P51532 1647 aa35.02■■■■□ 3.2
RAPGEF5-211ENST00000497668 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.01■■■■□ 3.2
RAPGEF5-211ENST00000497668 HMGXB3Q12766 1538 aa34.97■■■■□ 3.19
RAPGEF5-211ENST00000497668 SMARCA2P51531 1590 aa34.94■■■■□ 3.18
RAPGEF5-211ENST00000497668 CUX2O14529 1486 aa34.92■■■■□ 3.18
RAPGEF5-211ENST00000497668 ERCC6Q03468 1493 aa34.78■■■■□ 3.16
RAPGEF5-211ENST00000497668 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
RAPGEF5-211ENST00000497668 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.76■■■■□ 3.16
RAPGEF5-211ENST00000497668 NESP48681 1621 aa34.68■■■■□ 3.14
RAPGEF5-211ENST00000497668 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
RAPGEF5-211ENST00000497668 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.53■■■■□ 3.12
RAPGEF5-211ENST00000497668 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
RAPGEF5-211ENST00000497668 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.44■■■■□ 3.1
RAPGEF5-211ENST00000497668 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF5-211ENST00000497668 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF5-211ENST00000497668 WIZO95785 1651 aa34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF5-211ENST00000497668 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF5-211ENST00000497668 WDR62O43379 1518 aa33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF5-211ENST00000497668 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF5-211ENST00000497668 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF5-211ENST00000497668 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF5-211ENST00000497668 CFTRP13569 1480 aa33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF5-211ENST00000497668 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.69■■■□□ 2.98
RAPGEF5-211ENST00000497668 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF5-211ENST00000497668 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
RAPGEF5-211ENST00000497668 PRDM2Q13029 1718 aa33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF5-211ENST00000497668 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF5-211ENST00000497668 TRIM41Q8WV44 630 aa33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF5-211ENST00000497668 OSCARQ8IYS5 282 aa33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF5-211ENST00000497668 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.89
RAPGEF5-211ENST00000497668 IFT140Q96RY7 1462 aa33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF5-211ENST00000497668 TOPBP1Q92547 1522 aa33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF5-211ENST00000497668 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.95■■■□□ 2.86
RAPGEF5-211ENST00000497668 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
RAPGEF5-211ENST00000497668 ABCC8Q09428 1581 aa32.92■■■□□ 2.86
RAPGEF5-211ENST00000497668 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.91■■■□□ 2.86
RAPGEF5-211ENST00000497668 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.91■■■□□ 2.86
RAPGEF5-211ENST00000497668 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.91■■■□□ 2.86
RAPGEF5-211ENST00000497668 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
RAPGEF5-211ENST00000497668 ARHGEF11O15085 1522 aa32.77■■■□□ 2.84
RAPGEF5-211ENST00000497668 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
RAPGEF5-211ENST00000497668 CHD1O14646 1710 aa32.71■■■□□ 2.83
RAPGEF5-211ENST00000497668 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.68■■■□□ 2.823e-9■■□□□ 14.5
RAPGEF5-211ENST00000497668 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.55■■■□□ 2.8
RAPGEF5-211ENST00000497668 WDR97A6NE52 1622 aa32.5■■■□□ 2.79
RAPGEF5-211ENST00000497668 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.47■■■□□ 2.79
RAPGEF5-211ENST00000497668 CUX1P39880 1505 aa32.46■■■□□ 2.79
RAPGEF5-211ENST00000497668 SOGA1O94964 1423 aa32.46■■■□□ 2.79
RAPGEF5-211ENST00000497668 ARAP1Q96P48 1450 aa32.45■■■□□ 2.79
RAPGEF5-211ENST00000497668 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
RAPGEF5-211ENST00000497668 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.38■■■□□ 2.77
RAPGEF5-211ENST00000497668 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.37■■■□□ 2.77
RAPGEF5-211ENST00000497668 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.33■■■□□ 2.77
RAPGEF5-211ENST00000497668 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
RAPGEF5-211ENST00000497668 FBLN2P98095 1184 aa32.3■■■□□ 2.76
RAPGEF5-211ENST00000497668 GRIN2BQ13224 1484 aa32.25■■■□□ 2.75
RAPGEF5-211ENST00000497668 SYNJ1O43426 1573 aa32.22■■■□□ 2.75
RAPGEF5-211ENST00000497668 PBRM1Q86U86 1689 aa32.21■■■□□ 2.75
RAPGEF5-211ENST00000497668 SYNJ2O15056 1496 aa32.19■■■□□ 2.74
RAPGEF5-211ENST00000497668 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.16■■■□□ 2.74
RAPGEF5-211ENST00000497668 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.12■■■□□ 2.73
RAPGEF5-211ENST00000497668 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.1■■■□□ 2.73
RAPGEF5-211ENST00000497668 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
RAPGEF5-211ENST00000497668 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.94■■■□□ 2.7
RAPGEF5-211ENST00000497668 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
RAPGEF5-211ENST00000497668 TOP2BQ02880 1626 aa31.9■■■□□ 2.7
RAPGEF5-211ENST00000497668 ADAMTS12P58397 1594 aa31.9■■■□□ 2.7
RAPGEF5-211ENST00000497668 GRIN2AQ12879 1464 aa31.88■■■□□ 2.69
RAPGEF5-211ENST00000497668 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
RAPGEF5-211ENST00000497668 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
RAPGEF5-211ENST00000497668 CEP170Q5SW79 1584 aa31.82■■■□□ 2.68
RAPGEF5-211ENST00000497668 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.82■■■□□ 2.68
RAPGEF5-211ENST00000497668 NUP160Q12769 1436 aa31.82■■■□□ 2.68
RAPGEF5-211ENST00000497668 SHROOM2Q13796 1616 aa31.77■■■□□ 2.68
RAPGEF5-211ENST00000497668 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.71■■■□□ 2.67
RAPGEF5-211ENST00000497668 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.7■■■□□ 2.67
RAPGEF5-211ENST00000497668 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.48■■■□□ 2.63
RAPGEF5-211ENST00000497668 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.41■■■□□ 2.62
RAPGEF5-211ENST00000497668 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
RAPGEF5-211ENST00000497668 JPH4Q96JJ6 628 aa31.31■■■□□ 2.6
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