Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GOLGA2-211ENST00000496221 450 ntTSL 311.19□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 510.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-211ENST00000555625 784 ntTSL 510.89□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL-207ENST00000447745 793 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP11A-217ENST00000614170 3542 nt10.76□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-206ENST00000469758 1170 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-207ENST00000470476 1000 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LEO1-202ENST00000315141 1981 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2A-207ENST00000457914 448 ntTSL 310.26□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-202ENST00000553408 678 ntTSL 39.82□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 SMC6-204ENST00000428868 544 ntTSL 49.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2A-204ENST00000437821 627 ntTSL 59.64□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MNX1-206ENST00000479817 169 ntTSL 1 (best)9.56□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2A-205ENST00000438535 624 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL-205ENST00000436654 804 ntTSL 39.47□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PRPF40A-205ENST00000467114 546 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PCMTD2-210ENST00000610074 541 ntTSL 49.37□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2Z-202ENST00000504684 598 ntTSL 49.27□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 WIPI2-210ENST00000480238 470 ntTSL 39.23□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ANKHD1-219ENST00000506930 632 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PCMTD2-208ENST00000609764 572 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 GNL2-208ENST00000490029 635 ntTSL 29.05□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-212ENST00000555723 520 ntTSL 58.92□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-213ENST00000484464 573 ntTSL 48.85□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2Z-207ENST00000513342 4250 ntTSL 28.84□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PCM1-213ENST00000519802 796 ntTSL 28.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-220ENST00000511451 742 ntTSL 28.29□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 38.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-207ENST00000508115 654 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 GNL2-205ENST00000479255 422 ntTSL 27.96□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-221ENST00000511546 572 ntTSL 57.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-228ENST00000514730 569 ntTSL 57.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DNM1L-209ENST00000546757 2661 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC1-204ENST00000471488 726 ntTSL 57.28□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-209ENST00000504938 731 ntTSL 37.28□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DENND5A-215ENST00000532696 832 ntTSL 27.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-220ENST00000493426 581 ntTSL 37.08□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PCM1-220ENST00000523896 740 ntTSL 27□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.89□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-208ENST00000511452 419 ntTSL 56.66□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-204ENST00000502448 1760 ntTSL 1 (best)6.6□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-209ENST00000490048 646 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2Z-206ENST00000511373 769 ntTSL 25.62□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DNM1L-210ENST00000547078 450 ntTSL 45.43□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC6-223ENST00000480525 412 ntTSL 35.33□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-227ENST00000514675 578 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 48.09□□□□□ -1.115e-8■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LMAN2-206ENST00000513877 823 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LMAN2-205ENST00000506310 564 ntTSL 415.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 422.86■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 316.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 217.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.185e-9■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 LMNB1-204ENST00000463908 557 ntTSL 420.33■□□□□ 0.854e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.264e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 RPS27L-206ENST00000482846 2944 ntTSL 1 (best)16.25■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 NUDC-204ENST00000484772 607 ntTSL 213.35□□□□□ -0.274e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.784e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.884e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM4-205ENST00000482131 640 ntTSL 28.9□□□□□ -0.984e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A40-202ENST00000429674 1077 ntTSL 37.45□□□□□ -1.224e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 CDC27-209ENST00000532893 515 ntTSL 315.24■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 CDC27-217ENST00000575483 781 ntTSL 514.66□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 CDC27-206ENST00000528748 859 ntTSL 311.74□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 CDC27-208ENST00000532575 765 ntTSL 310.55□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 CDC27-215ENST00000573550 583 ntTSL 39□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 P4HB-211ENST00000477607 1110 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 P4HB-212ENST00000478034 811 ntTSL 215.23■□□□□ 0.034e-10■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 SENP6-211ENST00000493959 867 ntTSL 324.19■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-208ENST00000459644 582 ntTSL 315.33■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 33.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 512.08□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.556e-8■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 33.4
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-209ENST00000471930 846 ntTSL 513.68□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 33.4
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