RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.92■■■■■ 6.54
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SENP6-211ENST00000493959 ABCC9O60706 1549 aa49.53■■■■■ 5.52
SENP6-211ENST00000493959 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.22■■■■■ 5.15
SENP6-211ENST00000493959 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.2■■■■■ 5.15
SENP6-211ENST00000493959 NACADO15069 1562 aa47.01■■■■■ 5.12
SENP6-211ENST00000493959 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.48■■■■■ 5.03
SENP6-211ENST00000493959 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
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SENP6-211ENST00000493959 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.17■■■■■ 4.98
SENP6-211ENST00000493959 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.11■■■■■ 4.97
SENP6-211ENST00000493959 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.91■■■■■ 4.94
SENP6-211ENST00000493959 SCRIBQ14160 1630 aa45.55■■■■■ 4.88
SENP6-211ENST00000493959 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.11■■■■■ 4.81
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SENP6-211ENST00000493959 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.68■■■■■ 4.74
SENP6-211ENST00000493959 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.5■■■■■ 4.71
SENP6-211ENST00000493959 NCAPD3P42695 1498 aa43.47■■■■■ 4.55
SENP6-211ENST00000493959 SMARCA4P51532 1647 aa43.46■■■■■ 4.55
SENP6-211ENST00000493959 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.45■■■■■ 4.55
SENP6-211ENST00000493959 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
SENP6-211ENST00000493959 SMARCA2P51531 1590 aa43.24■■■■■ 4.51
SENP6-211ENST00000493959 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.16■■■■■ 4.5
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SENP6-211ENST00000493959 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
SENP6-211ENST00000493959 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.99■■■■■ 4.47
SENP6-211ENST00000493959 NESP48681 1621 aa42.72■■■■■ 4.43
SENP6-211ENST00000493959 WIZO95785 1651 aa42.64■■■■■ 4.42
SENP6-211ENST00000493959 ERCC6Q03468 1493 aa42.63■■■■■ 4.42
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SENP6-211ENST00000493959 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.32■■■■■ 4.37
SENP6-211ENST00000493959 CUX2O14529 1486 aa42.3■■■■■ 4.36
SENP6-211ENST00000493959 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.21■■■■■ 4.35
SENP6-211ENST00000493959 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.12■■■■■ 4.33
SENP6-211ENST00000493959 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.06■■■■■ 4.32
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SENP6-211ENST00000493959 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
SENP6-211ENST00000493959 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.88■■■■■ 4.29
SENP6-211ENST00000493959 CFTRP13569 1480 aa41.8■■■■■ 4.28
SENP6-211ENST00000493959 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.72■■■■■ 4.27
SENP6-211ENST00000493959 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.71■■■■■ 4.27
SENP6-211ENST00000493959 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.69■■■■■ 4.26
SENP6-211ENST00000493959 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.66■■■■■ 4.26
SENP6-211ENST00000493959 WDR62O43379 1518 aa41.57■■■■■ 4.25
SENP6-211ENST00000493959 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
SENP6-211ENST00000493959 PRDM2Q13029 1718 aa41.28■■■■■ 4.2
SENP6-211ENST00000493959 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
SENP6-211ENST00000493959 TOPBP1Q92547 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
SENP6-211ENST00000493959 ABCC8Q09428 1581 aa40.83■■■■■ 4.13
SENP6-211ENST00000493959 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
SENP6-211ENST00000493959 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.81■■■■■ 4.12
SENP6-211ENST00000493959 IFT140Q96RY7 1462 aa40.8■■■■■ 4.12
SENP6-211ENST00000493959 OSCARQ8IYS5 282 aa40.63■■■■■ 4.09
SENP6-211ENST00000493959 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
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SENP6-211ENST00000493959 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.52■■■■■ 4.08
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SENP6-211ENST00000493959 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
SENP6-211ENST00000493959 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
SENP6-211ENST00000493959 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
SENP6-211ENST00000493959 TRIM41Q8WV44 630 aa40.33■■■■■ 4.05
SENP6-211ENST00000493959 FBLN2P98095 1184 aa40.21■■■■■ 4.03
SENP6-211ENST00000493959 CHD1O14646 1710 aa40.1■■■■■ 4.01
SENP6-211ENST00000493959 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.04■■■■■ 4
SENP6-211ENST00000493959 WDR97A6NE52 1622 aa40.01■■■■■ 4
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SENP6-211ENST00000493959 GRIN2BQ13224 1484 aa39.98■■■■□ 3.99
SENP6-211ENST00000493959 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.96■■■■□ 3.99
SENP6-211ENST00000493959 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.95■■■■□ 3.99
SENP6-211ENST00000493959 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.95■■■■□ 3.99
SENP6-211ENST00000493959 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.95■■■■□ 3.99
SENP6-211ENST00000493959 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
SENP6-211ENST00000493959 SYNJ1O43426 1573 aa39.93■■■■□ 3.98
SENP6-211ENST00000493959 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
SENP6-211ENST00000493959 TOP2BQ02880 1626 aa39.91■■■■□ 3.98
SENP6-211ENST00000493959 ARHGEF11O15085 1522 aa39.89■■■■□ 3.98
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SENP6-211ENST00000493959 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.87■■■■□ 3.97
SENP6-211ENST00000493959 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.81■■■■□ 3.96
SENP6-211ENST00000493959 PBRM1Q86U86 1689 aa39.8■■■■□ 3.96
SENP6-211ENST00000493959 SYNJ2O15056 1496 aa39.77■■■■□ 3.96
SENP6-211ENST00000493959 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.73■■■■□ 3.95
SENP6-211ENST00000493959 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.64■■■■□ 3.94
SENP6-211ENST00000493959 ARAP1Q96P48 1450 aa39.56■■■■□ 3.92
SENP6-211ENST00000493959 ADAMTS12P58397 1594 aa39.47■■■■□ 3.91
SENP6-211ENST00000493959 GRIN2AQ12879 1464 aa39.47■■■■□ 3.91
SENP6-211ENST00000493959 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.44■■■■□ 3.9
SENP6-211ENST00000493959 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.42■■■■□ 3.9
SENP6-211ENST00000493959 CEP170Q5SW79 1584 aa39.32■■■■□ 3.88
SENP6-211ENST00000493959 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
SENP6-211ENST00000493959 IGF1RP08069 1367 aa39.22■■■■□ 3.87
SENP6-211ENST00000493959 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.19■■■■□ 3.86
SENP6-211ENST00000493959 KIF27Q86VH2 1401 aa39.18■■■■□ 3.86
SENP6-211ENST00000493959 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
SENP6-211ENST00000493959 JPH4Q96JJ6 628 aa39.06■■■■□ 3.84
SENP6-211ENST00000493959 SHROOM2Q13796 1616 aa39.03■■■■□ 3.84
SENP6-211ENST00000493959 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
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