Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 USP36-205ENST00000586531 898 ntTSL 325.19■■□□□ 1.623e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 USP36-220ENST00000591942 564 ntTSL 519.71■□□□□ 0.753e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 AC126755.1-203ENST00000538220 558 ntTSL 217.07■□□□□ 0.321e-11■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 USP36-206ENST00000586896 696 ntTSL 512.38□□□□□ -0.433e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 ZFAND2B-210ENST00000425849 484 ntTSL 312.06□□□□□ -0.483e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 SLTM-206ENST00000480144 2277 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-224ENST00000551154 423 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-11■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-223ENST00000550951 533 ntTSL 312.75□□□□□ -0.371e-11■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-218ENST00000549445 759 ntTSL 310.57□□□□□ -0.721e-11■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-208ENST00000547187 669 ntTSL 510.03□□□□□ -0.81e-11■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-216ENST00000549130 446 ntTSL 57.55□□□□□ -1.21e-11■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-206ENST00000546914 521 ntTSL 46.31□□□□□ -1.41e-11■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 NUSAP1-206ENST00000558582 546 ntTSL 57.29□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 NUSAP1-207ENST00000559046 580 ntTSL 57.29□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 NUSAP1-209ENST00000559659 529 ntTSL 27.17□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 FBXO7-208ENST00000484607 569 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.797e-12■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 CLUH-212ENST00000575624 595 ntTSL 323.23■■□□□ 1.311e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 ATP11A-214ENST00000493489 583 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 APOH-203ENST00000581797 748 ntTSL 35.82□□□□□ -1.483e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 APOH-202ENST00000577982 707 ntTSL 53.89□□□□□ -1.793e-7■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-8■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 515.01□□□□□ -0.012e-8■□□□□ 8.3
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SF3B4Q15427 RPS6KA1-209ENST00000524436 560 ntTSL 47.73□□□□□ -1.172e-8■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 METAP2-208ENST00000549808 538 ntTSL 43.88□□□□□ -1.792e-8■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 METAP2-204ENST00000546478 232 ntTSL 23.85□□□□□ -1.792e-8■□□□□ 8.3
SF3B4Q15427 DDI2-204ENST00000486680 1501 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.248e-13■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.351e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 LEMD3-203ENST00000541171 856 ntTSL 221.93■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RAB10-204ENST00000495146 1292 ntTSL 521.02■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ERMP1-205ENST00000487088 2799 ntTSL 520.85■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-205ENST00000504224 560 ntTSL 419.67■□□□□ 0.741e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MBOAT7-204ENST00000414665 876 ntTSL 218.64■□□□□ 0.571e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EDEM3-206ENST00000474725 1911 ntTSL 217.84■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ERMP1-206ENST00000489219 3293 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.411e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MBOAT7-210ENST00000474910 629 ntTSL 217.57■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 DOT1L-207ENST00000586024 725 ntTSL 316.63■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ERMP1-203ENST00000462592 3554 ntTSL 216.59■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-204ENST00000503659 558 ntTSL 416.58■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 8.2
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SF3B4Q15427 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PKMYT1-207ENST00000572059 880 ntTSL 514.67□□□□□ -0.065e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 GRIPAP1-213ENST00000621664 471 ntTSL 214.53□□□□□ -0.081e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 514.49□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 GANAB-205ENST00000526210 533 ntTSL 414.12□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-204ENST00000526494 399 ntTSL 414.1□□□□□ -0.155e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 GANAB-204ENST00000525994 390 ntTSL 414.03□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 GRIPAP1-214ENST00000622231 367 ntTSL 514.01□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 POLR2A-208ENST00000576952 532 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-212ENST00000527805 4841 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.225e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CSAG1-201ENST00000361211 630 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TARDBP-215ENST00000613864 584 ntTSL 413.04□□□□□ -0.325e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RBM22-206ENST00000521464 731 ntTSL 412.85□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MBOAT7-209ENST00000464098 493 ntTSL 212.84□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 KDM5C-206ENST00000428012 766 ntTSL 312.81□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MRS2-206ENST00000483634 1750 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MBOAT7-208ENST00000453320 557 ntTSL 412.01□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEC61A1-206ENST00000491668 558 ntTSL 411.46□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-219ENST00000532931 481 ntTSL 311.16□□□□□ -0.625e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 GANAB-209ENST00000529737 577 ntTSL 411.1□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MBD1-218ENST00000589541 836 ntTSL 310.78□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 KDM5C-213ENST00000495519 600 ntTSL 310.61□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 MRS2-205ENST00000446191 546 ntTSL 310.38□□□□□ -0.751e-7■□□□□ 8.2
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