RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.53■■■■□ 3.44
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.48■■■□□ 2.79
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC9O60706 1549 aa31.9■■■□□ 2.7
CSAG1-201ENST00000361211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.6■■■□□ 2.49
CSAG1-201ENST00000361211 NACADO15069 1562 aa30.54■■■□□ 2.48
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.52■■■□□ 2.48
CSAG1-201ENST00000361211 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CSAG1-201ENST00000361211 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.33■■■□□ 2.45
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.19■■■□□ 2.42
CSAG1-201ENST00000361211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.96■■■□□ 2.39
CSAG1-201ENST00000361211 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
CSAG1-201ENST00000361211 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.75■■■□□ 2.35
CSAG1-201ENST00000361211 SCRIBQ14160 1630 aa29.7■■■□□ 2.34
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.37■■■□□ 2.29
CSAG1-201ENST00000361211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.33■■■□□ 2.29
CSAG1-201ENST00000361211 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CSAG1-201ENST00000361211 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.84■■■□□ 2.21
CSAG1-201ENST00000361211 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.65■■■□□ 2.18
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCA4P51532 1647 aa28.38■■■□□ 2.13
CSAG1-201ENST00000361211 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CSAG1-201ENST00000361211 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.23■■■□□ 2.11
CSAG1-201ENST00000361211 NCAPD3P42695 1498 aa28.2■■■□□ 2.1
CSAG1-201ENST00000361211 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.19■■■□□ 2.1
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCA2P51531 1590 aa28.16■■■□□ 2.1
CSAG1-201ENST00000361211 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.07■■■□□ 2.08
CSAG1-201ENST00000361211 HMGXB3Q12766 1538 aa28.07■■■□□ 2.08
CSAG1-201ENST00000361211 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CSAG1-201ENST00000361211 WIZO95785 1651 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAG1-201ENST00000361211 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CSAG1-201ENST00000361211 NESP48681 1621 aa27.61■■■□□ 2.01
CSAG1-201ENST00000361211 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CSAG1-201ENST00000361211 ERCC6Q03468 1493 aa27.46■■□□□ 1.99
CSAG1-201ENST00000361211 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.46■■□□□ 1.99
CSAG1-201ENST00000361211 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.37■■□□□ 1.97
CSAG1-201ENST00000361211 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.27■■□□□ 1.96
CSAG1-201ENST00000361211 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.26■■□□□ 1.95
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.23■■□□□ 1.95
CSAG1-201ENST00000361211 CFTRP13569 1480 aa27.21■■□□□ 1.95
CSAG1-201ENST00000361211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CSAG1-201ENST00000361211 CUX2O14529 1486 aa27.19■■□□□ 1.94
CSAG1-201ENST00000361211 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.08■■□□□ 1.93
CSAG1-201ENST00000361211 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.05■■□□□ 1.92
CSAG1-201ENST00000361211 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CSAG1-201ENST00000361211 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.03■■□□□ 1.92
CSAG1-201ENST00000361211 PRDM2Q13029 1718 aa26.99■■□□□ 1.91
CSAG1-201ENST00000361211 WDR62O43379 1518 aa26.95■■□□□ 1.91
CSAG1-201ENST00000361211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CSAG1-201ENST00000361211 TOPBP1Q92547 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
CSAG1-201ENST00000361211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.6■■□□□ 1.85
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC8Q09428 1581 aa26.56■■□□□ 1.84
CSAG1-201ENST00000361211 IFT140Q96RY7 1462 aa26.47■■□□□ 1.83
CSAG1-201ENST00000361211 CUX1P39880 1505 aa26.44■■□□□ 1.82
CSAG1-201ENST00000361211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.42■■□□□ 1.82
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CSAG1-201ENST00000361211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CSAG1-201ENST00000361211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.36■■□□□ 1.81
CSAG1-201ENST00000361211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.33■■□□□ 1.81
CSAG1-201ENST00000361211 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CSAG1-201ENST00000361211 SOGA1O94964 1423 aa26.28■■□□□ 1.8
CSAG1-201ENST00000361211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.797e-7■■■□□ 16.6
CSAG1-201ENST00000361211 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
CSAG1-201ENST00000361211 SYNJ1O43426 1573 aa26.2■■□□□ 1.78
CSAG1-201ENST00000361211 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG1-201ENST00000361211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CSAG1-201ENST00000361211 TOP2BQ02880 1626 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG1-201ENST00000361211 WDR97A6NE52 1622 aa26.15■■□□□ 1.78
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.08■■□□□ 1.77
CSAG1-201ENST00000361211 OSCARQ8IYS5 282 aa26.02■■□□□ 1.76
CSAG1-201ENST00000361211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26■■□□□ 1.75
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.99■■□□□ 1.75
CSAG1-201ENST00000361211 GRIN2BQ13224 1484 aa25.98■■□□□ 1.75
CSAG1-201ENST00000361211 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.98■■□□□ 1.75
CSAG1-201ENST00000361211 CHD1O14646 1710 aa25.97■■□□□ 1.75
CSAG1-201ENST00000361211 PBRM1Q86U86 1689 aa25.96■■□□□ 1.75
CSAG1-201ENST00000361211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CSAG1-201ENST00000361211 FBLN2P98095 1184 aa25.89■■□□□ 1.74
CSAG1-201ENST00000361211 SYNJ2O15056 1496 aa25.83■■□□□ 1.73
CSAG1-201ENST00000361211 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS12P58397 1594 aa25.77■■□□□ 1.72
CSAG1-201ENST00000361211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.74■■□□□ 1.71
CSAG1-201ENST00000361211 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.69■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 GRIN2AQ12879 1464 aa25.67■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.67■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF11O15085 1522 aa25.67■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 KIF27Q86VH2 1401 aa25.64■■□□□ 1.7
CSAG1-201ENST00000361211 IGF1RP08069 1367 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG1-201ENST00000361211 CEP170Q5SW79 1584 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM41Q8WV44 630 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG1-201ENST00000361211 NUP160Q12769 1436 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAG1-201ENST00000361211 CUL7Q14999 1698 aa25.49■■□□□ 1.67
CSAG1-201ENST00000361211 ARAP1Q96P48 1450 aa25.48■■□□□ 1.67
CSAG1-201ENST00000361211 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.47■■□□□ 1.67
CSAG1-201ENST00000361211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.42■■□□□ 1.66
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.39■■□□□ 1.66
CSAG1-201ENST00000361211 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.38■■□□□ 1.65
CSAG1-201ENST00000361211 SHROOM2Q13796 1616 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms