Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PHC3-204ENST00000472330 609 ntTSL 36.39□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 PHC3-205ENST00000474275 2427 ntTSL 25.77□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 FAM126A-205ENST00000440481 6337 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 516.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 XPO1-208ENST00000437159 537 ntTSL 56.73□□□□□ -1.338e-7■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 PRR4-213ENST00000546265 534 ntTSL 512.8□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 PRR4-208ENST00000541175 384 ntTSL 26.59□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-207ENST00000640476 1750 ntTSL 521.94■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-10■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.231e-10■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 PRRC2A-206ENST00000464890 593 ntTSL 216.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 218.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 35.8
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.239e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 FAM193B-213ENST00000510429 839 ntTSL 317.81■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-210ENST00000469193 647 ntTSL 324.93■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-204ENST00000460560 2111 ntTSL 520.24■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-208ENST00000464865 1228 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-222ENST00000490760 574 ntTSL 512.52□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-227ENST00000495257 573 ntTSL 411.03□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-215ENST00000477571 3488 ntTSL 510.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-205ENST00000461089 617 ntTSL 49.71□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-209ENST00000467233 550 ntTSL 37.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC37A3-206ENST00000462881 551 ntTSL 45.77□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-210ENST00000595951 532 ntTSL 412.82□□□□□ -0.366e-13■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-212ENST00000581319 481 ntTSL 39.62□□□□□ -0.875e-12■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 515.1■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-213ENST00000476273 668 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-211ENST00000471589 892 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.568e-9■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 LDLR-213ENST00000560502 509 ntTSL 214.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 SMARCC2-211ENST00000550859 656 ntTSL 38.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 35.7
UTP3Q9NQZ2 NAP1L4-215ENST00000528363 685 ntTSL 27.71□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 29.91□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 MAP1S-204ENST00000594212 1132 ntTSL 1 (best)22.58■■□□□ 1.216e-6■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 HDHD2-205ENST00000588183 2224 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 HDHD2-204ENST00000587841 788 ntTSL 317■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 AC012254.2-201ENST00000602459 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.43■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.022e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-11■■■■■ 35.6
UTP3Q9NQZ2 LEMD2-203ENST00000442696 839 ntTSL 523.83■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 CLK1-211ENST00000481641 690 ntTSL 419.75■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 LMAN2-203ENST00000502721 639 ntTSL 314.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 CLK1-212ENST00000482590 626 ntTSL 29.88□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 CLK1-213ENST00000492793 596 ntTSL 47□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 516.09■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 SLC3A2-221ENST00000544377 589 ntTSL 417.83■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 SLC3A2-211ENST00000538084 741 ntTSL 315.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 FLNA-214ENST00000474072 430 ntTSL 217.98■□□□□ 0.476e-8■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 CHD4-204ENST00000535810 607 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 MRPS25-207ENST00000496484 823 ntTSL 210.92□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 MRPS25-206ENST00000474866 540 ntTSL 310.79□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 ANKHD1-206ENST00000412116 1826 ntTSL 59.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 35.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC1B-208ENST00000432343 839 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 DDX5-223ENST00000583212 543 ntTSL 46.72□□□□□ -1.339e-21■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 214.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 FLNA-208ENST00000438732 696 ntTSL 518.6■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 SEC13-215ENST00000477547 1313 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-207ENST00000594990 558 ntTSL 516.63■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 35.4
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.78e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.638e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.478e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-210ENST00000522397 852 ntTSL 320.87■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.678e-7■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-207ENST00000521086 2966 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 35.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4849.7 ms