Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC1Q9Y5R8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms