Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20AQ9NP66 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20AQ9NP66 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms