Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM9Q9C026 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms