Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC35C1Q96A29 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms