Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC2Q16515 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC2Q16515 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms