Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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