Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-1P43699 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms