Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-206ENST00000589629 728 ntTSL 314.45□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.07□□□□□ -1.443e-62■■■■■ 27.7
RPS3P23396 RPS4X-203ENST00000470671 610 ntTSL 33.44□□□□□ -1.865e-18■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CALM1-211ENST00000555267 554 ntTSL 21.74□□□□□ -2.132e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CALM1-204ENST00000553422 438 ntTSL 30.29□□□□□ -2.362e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 LDHA-212ENST00000495052 682 ntTSL 510.69□□□□□ -0.73e-15■■■■■ 27.7
RPS3P23396 PHGDH-227ENST00000641811 1031 nt16.85■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 27.7
RPS3P23396 SERPINF1-207ENST00000572048 573 ntTSL 28.66□□□□□ -1.025e-22■■■■■ 27.7
RPS3P23396 LGALS3BP-213ENST00000588990 618 ntTSL 516.8■□□□□ 0.283e-25■■■■■ 27.7
RPS3P23396 LGALS3BP-212ENST00000588899 668 ntTSL 316.77■□□□□ 0.283e-25■■■■■ 27.7
RPS3P23396 SLC16A1-203ENST00000443580 1099 ntTSL 39.39□□□□□ -0.919e-8■■■■■ 27.7
RPS3P23396 MRPS24-202ENST00000414932 1727 ntTSL 222.87■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 317.71■□□□□ 0.435e-23■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.17□□□□□ -1.422e-22■■■■■ 27.7
RPS3P23396 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.792e-8■■■■■ 27.7
RPS3P23396 PSMA1-212ENST00000532256 588 ntTSL 216.01■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 27.7
RPS3P23396 PSMA1-213ENST00000533068 571 ntTSL 413.65□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CES1-208ENST00000566555 659 ntTSL 320.57■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 27.7
RPS3P23396 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 PSMF1-209ENST00000479715 660 ntTSL 312.98□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 27.7
RPS3P23396 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ALG1-203ENST00000586840 582 ntTSL 423.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6AP1-205ENST00000446552 571 ntTSL 423.32■■□□□ 1.325e-9■■■■■ 27.6
RPS3P23396 ATP6AP1-204ENST00000439372 604 ntTSL 422.7■■□□□ 1.225e-9■■■■■ 27.6
RPS3P23396 FDFT1-219ENST00000531249 768 ntTSL 213.36□□□□□ -0.277e-10■■■■■ 27.6
RPS3P23396 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-41■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PHGDH-203ENST00000462324 767 ntTSL 512.94□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PHGDH-222ENST00000641587 566 nt9.57□□□□□ -0.887e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PHGDH-206ENST00000493622 742 ntTSL 58.95□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 ATP5O-207ENST00000487374 469 ntTSL 515.19■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 NARS-207ENST00000587675 1002 ntTSL 215.81■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 NARS-212ENST00000591599 584 ntTSL 511.78□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 NARS-208ENST00000588661 582 ntTSL 59.79□□□□□ -0.847e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 LGALS3BP-208ENST00000588198 1132 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-25■■■■■ 27.6
RPS3P23396 TXNDC12-204ENST00000472624 800 ntTSL 513.03□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 27.6
RPS3P23396 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 27.6
RPS3P23396 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.999e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 CIDEB-203ENST00000554411 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 27.6
RPS3P23396 COX6A1-202ENST00000549525 767 nt6.4□□□□□ -1.386e-26■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.393e-20■■■■■ 27.6
RPS3P23396 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.479e-14■■■■■ 27.6
RPS3P23396 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 315.45■□□□□ 0.063e-19■■■■■ 27.6
RPS3P23396 GALK1-209ENST00000592997 717 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PHGDH-226ENST00000641756 2132 nt17.66■□□□□ 0.424e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PHGDH-230ENST00000641927 1678 nt17.26■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 211.76□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 27.6
RPS3P23396 TGM2-204ENST00000468262 1862 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CRYZ-206ENST00000441120 677 ntTSL 39.17□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CRYZ-202ENST00000370870 888 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 27.5
RPS3P23396 EIF4A1-214ENST00000580461 909 ntTSL 212.66□□□□□ -0.381e-12■■■■■ 27.5
RPS3P23396 EIF4A1-213ENST00000579139 568 ntTSL 411.71□□□□□ -0.531e-12■■■■■ 27.5
RPS3P23396 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-12■■■■■ 27.5
RPS3P23396 EIF4A1-224ENST00000582213 560 ntTSL 43.59□□□□□ -1.831e-12■■■■■ 27.5
RPS3P23396 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-19■■■■■ 27.5
RPS3P23396 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-19■■■■■ 27.5
RPS3P23396 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.272e-19■■■■■ 27.5
RPS3P23396 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-19■■■■■ 27.5
RPS3P23396 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-19■■■■■ 27.5
RPS3P23396 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-19■■■■■ 27.5
RPS3P23396 COMMD4-218ENST00000567377 461 ntTSL 317.61■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 27.5
RPS3P23396 COMMD4-220ENST00000567720 544 ntTSL 416.86■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 27.5
RPS3P23396 TXNDC15-210ENST00000511070 1006 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 27.5
RPS3P23396 TXNDC15-205ENST00000506916 517 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 27.5
RPS3P23396 TXNDC15-208ENST00000508810 579 ntTSL 314.91□□□□□ -0.023e-10■■■■■ 27.5
RPS3P23396 COMMD4-223ENST00000568301 666 ntTSL 514.36□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 27.5
RPS3P23396 COMMD4-205ENST00000562310 568 ntTSL 314.21□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 27.5
RPS3P23396 TXNDC15-207ENST00000508779 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.27□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 27.5
RPS3P23396 TXNDC15-206ENST00000507024 2893 ntTSL 1 (best)10.45□□□□□ -0.743e-10■■■■■ 27.5
RPS3P23396 TXNDC15-201ENST00000358387 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-208ENST00000482684 837 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.821e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-201ENST00000374484 658 ntTSL 313.25□□□□□ -0.291e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-206ENST00000465956 961 ntTSL 211.54□□□□□ -0.561e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-209ENST00000487637 1378 ntTSL 210.77□□□□□ -0.691e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-205ENST00000462802 1054 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-11■■■■■ 27.5
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