Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms