Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1O95476 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms