Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCER2I3L3R5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms