Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZNF248-204ENST00000395873 698 ntTSL 320.67■□□□□ 0.92e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 217.76■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 EP400NL-210ENST00000537558 861 ntTSL 417.33■□□□□ 0.362e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-206ENST00000485560 1705 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 MYO19-208ENST00000611794 854 ntTSL 315.95■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 EP400NL-212ENST00000539351 564 ntTSL 415.52■□□□□ 0.082e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CHRD-213ENST00000482014 560 ntTSL 414.79□□□□□ -0.042e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 GGA3-216ENST00000583282 550 ntTSL 413.82□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FUBP1-213ENST00000492724 583 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TSTD2-201ENST00000341170 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TSTD2-204ENST00000375172 1503 ntTSL 511.81□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-203ENST00000395867 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 GGA3-204ENST00000578208 478 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 MYO19-212ENST00000614416 548 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FUBP1-209ENST00000487684 535 ntTSL 29.89□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 GGA3-206ENST00000578773 432 ntTSL 59.84□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 GGA3-209ENST00000580646 829 ntTSL 49.59□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 GGA3-219ENST00000584550 598 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SNRPN-204ENST00000400098 525 ntTSL 48.65□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NPAS2-207ENST00000471974 513 ntTSL 38.64□□□□□ -1.032e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SNRPN-206ENST00000553597 849 ntTSL 37.9□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.412e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.462e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZNF248-205ENST00000395874 436 ntTSL 35.08□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SDR39U1-207ENST00000553937 217 ntTSL 38.7□□□□□ -1.027e-29■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 39.63□□□□□ -0.874e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 56.04□□□□□ -1.444e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.189e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-223ENST00000494976 636 ntTSL 311.94□□□□□ -0.59e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-215ENST00000457887 762 ntTSL 510.26□□□□□ -0.779e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-221ENST00000483622 566 ntTSL 58.74□□□□□ -1.019e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-207ENST00000429217 762 ntTSL 58.36□□□□□ -1.079e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-216ENST00000461338 674 ntTSL 38.36□□□□□ -1.079e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-212ENST00000440506 550 ntTSL 36.38□□□□□ -1.399e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-213ENST00000441987 533 ntTSL 54.87□□□□□ -1.639e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.669e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-217ENST00000463502 570 ntTSL 34.69□□□□□ -1.669e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.739e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-209ENST00000432692 576 ntTSL 53.83□□□□□ -1.89e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.849e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-208ENST00000432002 600 ntTSL 53.3□□□□□ -1.889e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-220ENST00000477952 427 ntTSL 23.01□□□□□ -1.939e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.049e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.595e-9■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SDC2-205ENST00000520233 563 ntTSL 417.59■□□□□ 0.415e-9■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.065e-9■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SDC2-203ENST00000519587 557 ntTSL 413.97□□□□□ -0.175e-9■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.015e-9■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 47.54□□□□□ -1.23e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SUPT5H-212ENST00000598520 514 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-16■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 DLST-203ENST00000550473 474 ntTSL 35.88□□□□□ -1.471e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ATXN2L-222ENST00000567024 525 ntTSL 316.88■□□□□ 0.295e-45■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 METTL22-217ENST00000569597 404 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 METTL22-206ENST00000562973 586 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 RBM28-206ENST00000487602 715 ntTSL 58□□□□□ -1.133e-13■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 RBM28-207ENST00000488249 570 ntTSL 32.98□□□□□ -1.933e-13■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.354e-17■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.714e-17■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 YME1L1-204ENST00000396296 986 ntTSL 519.16■□□□□ 0.662e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 YME1L1-208ENST00000491542 912 ntTSL 213.57□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ELP2-223ENST00000543439 551 ntTSL 49.06□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ELP2-213ENST00000540730 578 ntTSL 48.06□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ELP2-212ENST00000540323 577 ntTSL 24.47□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ELP2-208ENST00000536373 759 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-11■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-11■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-11■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 210.91□□□□□ -0.663e-11■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-11■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.193e-11■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CEP95-215ENST00000582698 442 ntTSL 23.09□□□□□ -1.912e-17■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 USP48-214ENST00000532737 680 ntTSL 424.14■■□□□ 1.452e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 519.83■□□□□ 0.774e-14■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 MAD1L1-213ENST00000455998 557 ntTSL 419.21■□□□□ 0.672e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 USP48-210ENST00000489108 443 ntTSL 214.84□□□□□ -0.032e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 HSF1-211ENST00000533130 493 ntTSL 314.35□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CASS4-201ENST00000360314 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 511.72□□□□□ -0.534e-14■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-214ENST00000513091 591 ntTSL 311.64□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SRPRA-203ENST00000528744 856 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CASS4-203ENST00000497244 2871 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CEP135-203ENST00000506202 5129 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.072e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-203ENST00000503737 653 ntTSL 36.15□□□□□ -1.422e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FLVCR1-204ENST00000483790 599 ntTSL 35.39□□□□□ -1.552e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SNAP23-209ENST00000563873 368 ntTSL 34.64□□□□□ -1.672e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-215ENST00000514198 496 ntTSL 53.01□□□□□ -1.932e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)21.83■■□□□ 1.091e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 WDR13-206ENST00000479279 2486 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 WDR13-212ENST00000498631 859 ntTSL 219.06■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.7
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