RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.56■■■□□ 2.96
GGA3-216ENST00000583282 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.78■■■□□ 2.36
GGA3-216ENST00000583282 ABCC9O60706 1549 aa28.81■■■□□ 2.2
GGA3-216ENST00000583282 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
GGA3-216ENST00000583282 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.88■■■□□ 2.05
GGA3-216ENST00000583282 NACADO15069 1562 aa27.83■■■□□ 2.05
GGA3-216ENST00000583282 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.83■■■□□ 2.05
GGA3-216ENST00000583282 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.73■■■□□ 2.03
GGA3-216ENST00000583282 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.69■■■□□ 2.02
GGA3-216ENST00000583282 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.32■■□□□ 1.96
GGA3-216ENST00000583282 SCRIBQ14160 1630 aa27.28■■□□□ 1.96
GGA3-216ENST00000583282 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.98■■□□□ 1.91
GGA3-216ENST00000583282 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
GGA3-216ENST00000583282 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.82■■□□□ 1.88
GGA3-216ENST00000583282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
GGA3-216ENST00000583282 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.13■■□□□ 1.77
GGA3-216ENST00000583282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.08■■□□□ 1.77
GGA3-216ENST00000583282 SMARCA4P51532 1647 aa26.05■■□□□ 1.76
GGA3-216ENST00000583282 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GGA3-216ENST00000583282 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.99■■□□□ 1.75
GGA3-216ENST00000583282 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.91■■□□□ 1.74
GGA3-216ENST00000583282 SMARCA2P51531 1590 aa25.75■■□□□ 1.71
GGA3-216ENST00000583282 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.74■■□□□ 1.71
GGA3-216ENST00000583282 WIZO95785 1651 aa25.71■■□□□ 1.71
GGA3-216ENST00000583282 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.71■■□□□ 1.71
GGA3-216ENST00000583282 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
GGA3-216ENST00000583282 HMGXB3Q12766 1538 aa25.63■■□□□ 1.69
GGA3-216ENST00000583282 NCAPD3P42695 1498 aa25.6■■□□□ 1.69
GGA3-216ENST00000583282 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GGA3-216ENST00000583282 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GGA3-216ENST00000583282 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
GGA3-216ENST00000583282 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.06■■□□□ 1.6
GGA3-216ENST00000583282 NESP48681 1621 aa25.03■■□□□ 1.6
GGA3-216ENST00000583282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.97■■□□□ 1.59
GGA3-216ENST00000583282 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.89■■□□□ 1.57
GGA3-216ENST00000583282 PRDM2Q13029 1718 aa24.88■■□□□ 1.57
GGA3-216ENST00000583282 CFTRP13569 1480 aa24.84■■□□□ 1.57
GGA3-216ENST00000583282 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.83■■□□□ 1.57
GGA3-216ENST00000583282 ERCC6Q03468 1493 aa24.82■■□□□ 1.56
GGA3-216ENST00000583282 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.73■■□□□ 1.55
GGA3-216ENST00000583282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.7■■□□□ 1.54
GGA3-216ENST00000583282 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
GGA3-216ENST00000583282 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GGA3-216ENST00000583282 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.54■■□□□ 1.52
GGA3-216ENST00000583282 WDR62O43379 1518 aa24.46■■□□□ 1.51
GGA3-216ENST00000583282 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GGA3-216ENST00000583282 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.37■■□□□ 1.49
GGA3-216ENST00000583282 CUX2O14529 1486 aa24.36■■□□□ 1.49
GGA3-216ENST00000583282 ABCC8Q09428 1581 aa24.36■■□□□ 1.49
GGA3-216ENST00000583282 TOPBP1Q92547 1522 aa24.35■■□□□ 1.49
GGA3-216ENST00000583282 CUX1P39880 1505 aa24.3■■□□□ 1.48
GGA3-216ENST00000583282 SYNJ1O43426 1573 aa24.25■■□□□ 1.47
GGA3-216ENST00000583282 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
GGA3-216ENST00000583282 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.21■■□□□ 1.47
GGA3-216ENST00000583282 TOP2BQ02880 1626 aa24.18■■□□□ 1.46
GGA3-216ENST00000583282 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.18■■□□□ 1.46
GGA3-216ENST00000583282 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GGA3-216ENST00000583282 IFT140Q96RY7 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
GGA3-216ENST00000583282 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GGA3-216ENST00000583282 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.06■■□□□ 1.44
GGA3-216ENST00000583282 WDR97A6NE52 1622 aa24.04■■□□□ 1.44
GGA3-216ENST00000583282 SOGA1O94964 1423 aa24■■□□□ 1.43
GGA3-216ENST00000583282 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GGA3-216ENST00000583282 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GGA3-216ENST00000583282 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.9■■□□□ 1.42
GGA3-216ENST00000583282 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.87■■□□□ 1.41
GGA3-216ENST00000583282 PBRM1Q86U86 1689 aa23.86■■□□□ 1.41
GGA3-216ENST00000583282 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
GGA3-216ENST00000583282 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
GGA3-216ENST00000583282 TRIM41Q8WV44 630 aa23.82■■□□□ 1.4
GGA3-216ENST00000583282 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.77■■□□□ 1.4
GGA3-216ENST00000583282 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.73■■□□□ 1.39
GGA3-216ENST00000583282 GRIN2BQ13224 1484 aa23.72■■□□□ 1.39
GGA3-216ENST00000583282 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.72■■□□□ 1.39
GGA3-216ENST00000583282 KIF27Q86VH2 1401 aa23.67■■□□□ 1.38
GGA3-216ENST00000583282 CHD1O14646 1710 aa23.65■■□□□ 1.38
GGA3-216ENST00000583282 ADAMTS12P58397 1594 aa23.64■■□□□ 1.37
GGA3-216ENST00000583282 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.64■■□□□ 1.37
GGA3-216ENST00000583282 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
GGA3-216ENST00000583282 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.61■■□□□ 1.37
GGA3-216ENST00000583282 CUL7Q14999 1698 aa23.56■■□□□ 1.36
GGA3-216ENST00000583282 SYNJ2O15056 1496 aa23.53■■□□□ 1.36
GGA3-216ENST00000583282 FBLN2P98095 1184 aa23.49■■□□□ 1.35
GGA3-216ENST00000583282 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.49■■□□□ 1.35
GGA3-216ENST00000583282 IGF1RP08069 1367 aa23.46■■□□□ 1.35
GGA3-216ENST00000583282 GRIN2AQ12879 1464 aa23.44■■□□□ 1.34
GGA3-216ENST00000583282 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GGA3-216ENST00000583282 EEA1Q15075 1411 aa23.42■■□□□ 1.34
GGA3-216ENST00000583282 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GGA3-216ENST00000583282 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.38■■□□□ 1.33
GGA3-216ENST00000583282 CEP170Q5SW79 1584 aa23.37■■□□□ 1.33
GGA3-216ENST00000583282 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.31■■□□□ 1.32
GGA3-216ENST00000583282 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.31■■□□□ 1.32
GGA3-216ENST00000583282 PRXQ9BXM0 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
GGA3-216ENST00000583282 NUP160Q12769 1436 aa23.29■■□□□ 1.32
GGA3-216ENST00000583282 OSCARQ8IYS5 282 aa23.29■■□□□ 1.32
GGA3-216ENST00000583282 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.27■■□□□ 1.32
GGA3-216ENST00000583282 KIF21BO75037 1637 aa23.26■■□□□ 1.31
GGA3-216ENST00000583282 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.23■■□□□ 1.31
GGA3-216ENST00000583282 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms