Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRBQ9Y5M8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms