Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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