Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM4Q9UKN5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM4Q9UKN5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM4Q9UKN5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRDM4Q9UKN5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM4Q9UKN5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM4Q9UKN5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM4Q9UKN5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRDM4Q9UKN5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM4Q9UKN5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM4Q9UKN5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM4Q9UKN5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM4Q9UKN5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM4Q9UKN5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM4Q9UKN5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM4Q9UKN5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM4Q9UKN5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRDM4Q9UKN5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM4Q9UKN5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM4Q9UKN5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM4Q9UKN5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM4Q9UKN5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM4Q9UKN5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM4Q9UKN5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM4Q9UKN5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM4Q9UKN5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM4Q9UKN5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM4Q9UKN5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM4Q9UKN5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM4Q9UKN5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM4Q9UKN5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM4Q9UKN5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM4Q9UKN5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM4Q9UKN5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM4Q9UKN5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM4Q9UKN5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM4Q9UKN5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM4Q9UKN5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM4Q9UKN5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM4Q9UKN5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM4Q9UKN5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM4Q9UKN5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM4Q9UKN5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM4Q9UKN5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PRDM4Q9UKN5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM4Q9UKN5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM4Q9UKN5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM4Q9UKN5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM4Q9UKN5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM4Q9UKN5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM4Q9UKN5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM4Q9UKN5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM4Q9UKN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM4Q9UKN5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM4Q9UKN5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM4Q9UKN5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM4Q9UKN5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM4Q9UKN5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM4Q9UKN5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM4Q9UKN5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM4Q9UKN5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM4Q9UKN5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM4Q9UKN5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM4Q9UKN5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM4Q9UKN5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM4Q9UKN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM4Q9UKN5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM4Q9UKN5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM4Q9UKN5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM4Q9UKN5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM4Q9UKN5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM4Q9UKN5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM4Q9UKN5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM4Q9UKN5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM4Q9UKN5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM4Q9UKN5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM4Q9UKN5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM4Q9UKN5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM4Q9UKN5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM4Q9UKN5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM4Q9UKN5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM4Q9UKN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM4Q9UKN5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM4Q9UKN5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM4Q9UKN5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM4Q9UKN5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM4Q9UKN5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM4Q9UKN5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM4Q9UKN5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM4Q9UKN5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PRDM4Q9UKN5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM4Q9UKN5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM4Q9UKN5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM4Q9UKN5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM4Q9UKN5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM4Q9UKN5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM4Q9UKN5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM4Q9UKN5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms