Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-215ENST00000580784 1081 ntTSL 1 (best)32.94■■■□□ 2.864e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PHF13-202ENST00000495385 798 ntTSL 330.74■■■□□ 2.513e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 528.9■■■□□ 2.224e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-224ENST00000584672 401 ntTSL 323.13■■□□□ 1.294e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-208ENST00000578501 1124 ntTSL 220.97■□□□□ 0.954e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.934e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-220ENST00000581737 631 ntTSL 220.55■□□□□ 0.884e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-206ENST00000577578 928 ntTSL 219.21■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-204ENST00000449372 3930 ntTSL 519.16■□□□□ 0.664e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-207ENST00000628646 4264 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.444e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-201ENST00000293748 4556 ntTSL 516.29■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 328.28■■■□□ 2.129e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 227.23■■□□□ 1.957e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)23.85■■□□□ 1.417e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 220.44■□□□□ 0.867e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 525.67■■□□□ 1.72e-44■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.353e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PGGHG-205ENST00000474221 4418 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 329.82■■■□□ 2.361e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 529.33■■■□□ 2.291e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 429.11■■■□□ 2.251e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 429.11■■■□□ 2.251e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 328.88■■■□□ 2.211e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 422.69■■□□□ 1.221e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 321.13■□□□□ 0.971e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 418.36■□□□□ 0.531e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 223.01■■□□□ 1.278e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 519.6■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.013e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 CARS2-216ENST00000537743 466 ntTSL 57.29□□□□□ -1.241e-7■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 523.24■■□□□ 1.312e-9■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.732e-9■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 412.92□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.212e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 UQCRQ-204ENST00000480372 509 ntTSL 228.39■■■□□ 2.142e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 UQCRQ-206ENST00000498309 874 ntTSL 225.1■■□□□ 1.612e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.122e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 UQCRQ-202ENST00000378667 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 UQCRQ-205ENST00000496429 258 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-8■■■■□ 23
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)36.63■■■■□ 3.463e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SSBP4-208ENST00000600628 550 ntTSL 313.7□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)37.4■■■■□ 3.583e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 336.7■■■■□ 3.473e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 343.02■■■■■ 4.488e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.738e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.938e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 GALNS-204ENST00000562831 609 ntTSL 338.25■■■■□ 3.718e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM18-206ENST00000461640 844 ntTSL 334.79■■■■□ 3.167e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.045e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.978e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM18-207ENST00000477202 1767 ntTSL 232.79■■■□□ 2.848e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.818e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.815e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 NCLN-204ENST00000588428 1080 ntTSL 532.35■■■□□ 2.774e-8■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 GALNS-207ENST00000565364 1075 ntTSL 1 (best)31.76■■■□□ 2.678e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 531.51■■■□□ 2.635e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.394e-8■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 RABEP1-207ENST00000575991 551 ntTSL 428.79■■■□□ 2.23e-9■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-214ENST00000508183 1410 ntTSL 1 (best)28.65■■■□□ 2.188e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM18-204ENST00000418447 623 ntTSL 327.02■■□□□ 1.928e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.97■■□□□ 1.918e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)25.2■■□□□ 1.623e-9■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 NCLN-203ENST00000587740 1210 ntTSL 1 (best)24.96■■□□□ 1.598e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-223ENST00000513495 600 ntTSL 423.97■■□□□ 1.438e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-220ENST00000511002 1124 ntTSL 523.73■■□□□ 1.398e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-212ENST00000507801 538 ntTSL 422.76■■□□□ 1.238e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.25e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.043e-9■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-206ENST00000502669 3484 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.948e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-204ENST00000502350 2258 ntTSL 220.48■□□□□ 0.878e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 219.93■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 319.38■□□□□ 0.698e-9■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.618e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.595e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 218.66■□□□□ 0.588e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 217.55■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.44e-8■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-9■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.53□□□□□ -28e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 328.2■■■□□ 2.16e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.196e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)33.23■■■□□ 2.912e-6■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.129e-7■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 HBP1-207ENST00000468401 573 ntTSL 421.29■■□□□ 16e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 HBP1-213ENST00000497535 702 ntTSL 220.29■□□□□ 0.846e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 HBP1-206ENST00000468116 579 ntTSL 420.29■□□□□ 0.846e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.656e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 217.14■□□□□ 0.336e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 214.89□□□□□ -0.036e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.336e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 211.62□□□□□ -0.556e-12■■■■□ 22.9
DROSHAQ9NRR4 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.76e-12■■■■□ 22.9
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