Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STN1Q9H668 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STN1Q9H668 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STN1Q9H668 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STN1Q9H668 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STN1Q9H668 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STN1Q9H668 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms