Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LSG1Q9H089 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms