Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms