Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN1Q15223 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NECTIN1Q15223 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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