Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 STX5-208ENST00000492066 1627 ntTSL 519.75■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 ESRP2-211ENST00000566774 2072 ntTSL 216.33■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 CASC3-203ENST00000418132 1986 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 ANXA6-208ENST00000519644 728 ntTSL 513.91□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RHOT2-217ENST00000567589 550 ntTSL 318.5■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 IST1-224ENST00000566536 612 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 GALE-211ENST00000469556 882 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 DLG5-204ENST00000463362 2927 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-213ENST00000470873 552 ntTSL 417.41■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-214ENST00000477791 665 ntTSL 215.13■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-217ENST00000493804 807 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-215ENST00000479225 568 ntTSL 312.26□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-23■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.38□□□□□ -0.915e-23■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.635e-23■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.695e-23■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VDAC1-204ENST00000425992 703 ntTSL 322.49■■□□□ 1.193e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VDAC1-205ENST00000466080 831 ntTSL 36.98□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 TAF1C-206ENST00000562330 1044 ntTSL 317.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 TAF1C-213ENST00000565279 912 ntTSL 516.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 TAF1C-205ENST00000561955 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 TAF1C-220ENST00000569505 564 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 LAMA5-212ENST00000495695 780 ntTSL 218.43■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 420.26■□□□□ 0.834e-36■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.717e-9■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VWA1-202ENST00000471398 458 ntTSL 316.41■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 VWA1-204ENST00000495558 819 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 42.3
EFTUD2Q15029 HLA-F-AS1-207ENST00000399247 1905 nt12.03□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 HLA-F-AS1-209ENST00000458236 2835 ntBASIC11.98□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 MICE-207ENST00000510438 1157 ntBASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 RFESD-203ENST00000458310 2788 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 RFESD-207ENST00000511684 615 ntTSL 38.37□□□□□ -1.075e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.715e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -25e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.158e-12■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 GTPBP4-205ENST00000491635 2220 ntTSL 210.22□□□□□ -0.778e-12■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-206ENST00000589607 573 ntTSL 414.64□□□□□ -0.077e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-210ENST00000591295 3017 ntTSL 513.59□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-209ENST00000590537 539 ntTSL 48.34□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.941e-6■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 HDLBP-247ENST00000498595 595 ntTSL 513.53□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 HDLBP-236ENST00000477477 340 ntTSL 510.56□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 TPP1-204ENST00000524611 470 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 TPP1-207ENST00000524924 289 ntTSL 37.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 TPP1-214ENST00000532191 433 ntTSL 27.05□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 42.2
EFTUD2Q15029 MBD1-213ENST00000586118 1012 ntTSL 316.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 SSBP3-208ENST00000444533 560 ntTSL 313.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 TRAF4-214ENST00000580073 449 ntTSL 312.67□□□□□ -0.382e-13■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 UBTF-208ENST00000529373 674 ntTSL 219.49■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 PBXIP1-204ENST00000490230 853 ntTSL 518.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 ISYNA1-209ENST00000582287 696 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 PBXIP1-206ENST00000498553 777 ntTSL 515.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 ISYNA1-214ENST00000583816 860 ntTSL 313.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 PBXIP1-205ENST00000493133 707 ntTSL 312.13□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 ISYNA1-212ENST00000583309 371 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 ISYNA1-207ENST00000581672 793 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 42.1
EFTUD2Q15029 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 PIEZO1-205ENST00000472168 663 ntTSL 214.29□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 213.27□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 UBAP2L-206ENST00000428595 1419 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 29.31□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 35.41□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HACD3-208ENST00000566239 393 ntTSL 212.44□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 PCGF1-206ENST00000489914 433 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.926e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.556e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 MBD1-227ENST00000592060 1952 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 42
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