Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAG2P55895 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAG2P55895 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAG2P55895 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAG2P55895 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAG2P55895 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAG2P55895 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAG2P55895 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAG2P55895 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAG2P55895 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAG2P55895 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAG2P55895 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAG2P55895 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAG2P55895 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAG2P55895 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms