Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms