Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms