Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SHPRH-209ENST00000521977 927 ntTSL 58.38□□□□□ -1.075e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-261ENST00000625882 484 ntTSL 58.2□□□□□ -1.15e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 DDX56-211ENST00000479602 440 ntTSL 28.04□□□□□ -1.121e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CKAP2-205ENST00000468284 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.98□□□□□ -1.135e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 37.82□□□□□ -1.165e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-290ENST00000627502 874 ntTSL 57.73□□□□□ -1.175e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 37.59□□□□□ -1.195e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 TMBIM6-228ENST00000553022 540 ntTSL 27.55□□□□□ -1.23e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 HMBOX1-204ENST00000517386 761 ntTSL 47.11□□□□□ -1.273e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CAT-202ENST00000525707 562 ntTSL 27.07□□□□□ -1.285e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RBBP4-211ENST00000477563 544 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 46.42□□□□□ -1.383e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-208ENST00000586001 587 ntTSL 36.23□□□□□ -1.411e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-203ENST00000414670 500 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-209ENST00000472147 668 ntTSL 35.4□□□□□ -1.543e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CAT-204ENST00000530343 752 ntTSL 25.34□□□□□ -1.555e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CKAP2-206ENST00000480747 537 ntAPPRIS ALT2 TSL 45.31□□□□□ -1.565e-7■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 54.68□□□□□ -1.665e-7■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 44.52□□□□□ -1.691e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 44.39□□□□□ -1.711e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-212ENST00000480226 585 ntTSL 44.34□□□□□ -1.713e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-216ENST00000493758 366 ntTSL 34.3□□□□□ -1.723e-10■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 SSR1-209ENST00000488834 585 ntTSL 44.06□□□□□ -1.766e-9■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.711e-6■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 NSD3-207ENST00000528304 508 ntTSL 34.29□□□□□ -1.727e-9■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 MARK3-217ENST00000559268 560 ntTSL 45.63□□□□□ -1.511e-8■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.3
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SF3B4Q15427 GTSF1-204ENST00000546931 902 ntTSL 55.12□□□□□ -1.593e-6■□□□□ 10.2
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SF3B4Q15427 POMGNT1-208ENST00000485714 2906 ntTSL 211.36□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 FCHO1-229ENST00000599766 747 ntTSL 315.51■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 10.2
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SF3B4Q15427 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-9■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NPDC1-205ENST00000488145 701 ntTSL 216.45■□□□□ 0.221e-9■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NPDC1-204ENST00000485589 506 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-9■□□□□ 10.2
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SF3B4Q15427 HID1-204ENST00000528902 2341 ntTSL 219.34■□□□□ 0.692e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-213ENST00000581676 458 ntTSL 518.61■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-206ENST00000530904 540 ntTSL 417.9■□□□□ 0.462e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-205ENST00000530857 820 ntTSL 315.87■□□□□ 0.132e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-210ENST00000534480 2514 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-203ENST00000525128 695 ntTSL 213.64□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.8□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 HID1-209ENST00000532900 619 ntTSL 411.62□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 GNL3L-203ENST00000489691 895 ntTSL 37.35□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 FAM13A-204ENST00000502914 587 ntTSL 44.43□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 210.65□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 510.53□□□□□ -0.723e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 310.5□□□□□ -0.733e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 29.3□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.973e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.37□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.133e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ZNF217-203ENST00000431687 779 ntTSL 56.54□□□□□ -1.362e-9■□□□□ 10.2
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