Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms