Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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