Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PNPO-211ENST00000641323 3657 nt13.74□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-206ENST00000584061 723 ntTSL 413.02□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-205ENST00000583599 696 ntTSL 411.75□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-209ENST00000641285 488 nt11.56□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-213ENST00000641511 453 nt9.88□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.491e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 321.5■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AKR1A1-209ENST00000481885 516 ntTSL 320.1■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AKR1A1-203ENST00000434299 840 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FARSA-206ENST00000587981 521 ntTSL 222.45■■□□□ 1.181e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 COPS6-209ENST00000483891 734 ntTSL 37.46□□□□□ -1.223e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.392e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPF-206ENST00000498176 715 ntTSL 1 (best)27.66■■■□□ 2.022e-14■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.752e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 525.54■■□□□ 1.681e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)24.96■■□□□ 1.591e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 LMNB1-204ENST00000463908 557 ntTSL 423.5■■□□□ 1.352e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)23.46■■□□□ 1.352e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.22e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 521.77■■□□□ 1.082e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NOP2-219ENST00000545492 657 ntTSL 221.77■■□□□ 1.082e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.041e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 521.48■■□□□ 1.032e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.031e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-211ENST00000532025 653 ntTSL 321.1■□□□□ 0.978e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 220.14■□□□□ 0.811e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.788e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)19.58■□□□□ 0.728e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 518.92■□□□□ 0.628e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.611e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.588e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NOP2-205ENST00000536124 689 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.558e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NOP2-209ENST00000538420 572 ntTSL 417.04■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-219ENST00000568989 498 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.038e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 MTHFD1-211ENST00000555709 803 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PSMD13-207ENST00000527982 2200 nt14.34□□□□□ -0.118e-11■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-9■■■□□ 14.7
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G3BP1Q13283 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■■□□ 14.7
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G3BP1Q13283 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.245e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.325e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.255e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.024e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.732e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.761e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.711e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.511e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 521.28■■□□□ 12e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.431e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 GRHPR-208ENST00000493368 1136 ntTSL 1 (best)19.56■□□□□ 0.727e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 DDB1-214ENST00000539426 805 ntTSL 313.41□□□□□ -0.265e-9■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 HNRNPA3-203ENST00000432457 643 ntTSL 312.16□□□□□ -0.467e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 222■■□□□ 1.111e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt20.05■□□□□ 0.81e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.051e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 59.84□□□□□ -0.831e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.592e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 ANXA6-204ENST00000517677 795 ntTSL 517.56■□□□□ 0.45e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.257e-7■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 CTNNA1-203ENST00000517534 416 ntTSL 210.3□□□□□ -0.761e-7■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 PAH-211ENST00000551114 1109 ntTSL 25.45□□□□□ -1.543e-7■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 PAH-216ENST00000635477 429 ntTSL 55.22□□□□□ -1.573e-7■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 PAH-218ENST00000635528 960 ntTSL 35.08□□□□□ -1.63e-7■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 ACSF2-211ENST00000506582 594 ntTSL 522.32■■□□□ 1.163e-6■■■□□ 14.6
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