Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED6P86452 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms