Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms