Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMUP48645 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMUP48645 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMUP48645 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMUP48645 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms