Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB9P17482 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms