Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms