Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 44.7
UTP3Q9NQZ2 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 44.7
UTP3Q9NQZ2 HYOU1-209ENST00000531694 2357 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-13■■■■■ 44.7
UTP3Q9NQZ2 ACO2-205ENST00000478010 644 ntTSL 213.86□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-229ENST00000466211 584 ntTSL 324.45■■□□□ 1.58e-6■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-243ENST00000494824 565 ntTSL 522.87■■□□□ 1.258e-6■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-213ENST00000428282 1005 ntTSL 318.51■□□□□ 0.558e-6■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.085e-8■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.235e-8■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 38.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 44.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-226ENST00000551892 748 ntTSL 322.88■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 MARS-217ENST00000549074 532 ntTSL 420.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 420.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 220.01■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 MARS-213ENST00000548674 749 ntTSL 516.36■□□□□ 0.211e-10■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 218.78■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 MPZL1-206ENST00000464954 607 ntTSL 222.88■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 ADD1-209ENST00000503169 2394 ntTSL 29.47□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-7■■■■■ 44.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 44.4
UTP3Q9NQZ2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 44.4
UTP3Q9NQZ2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 44.4
UTP3Q9NQZ2 RNF182-204ENST00000488300 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 44.4
UTP3Q9NQZ2 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.514e-6■■■■■ 44.4
UTP3Q9NQZ2 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 529.95■■■□□ 2.382e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 NOP56-214ENST00000484998 998 ntTSL 58.45□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 SLC6A6-201ENST00000452151 284 ntTSL 57.41□□□□□ -1.227e-7■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-210ENST00000484835 931 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 312.08□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 313.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 510.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 44.3
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 28.58□□□□□ -1.049e-7■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-220ENST00000613421 5156 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-205ENST00000578348 2251 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-223ENST00000621870 4034 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-222ENST00000621217 4181 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.853e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 58.02□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MED15-227ENST00000486656 577 ntTSL 420.02■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 UBC-214ENST00000546271 559 ntTSL 412.75□□□□□ -0.379e-9■■■■■ 44.2
UTP3Q9NQZ2 MED13-204ENST00000581994 2213 nt11.25□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 44.1
UTP3Q9NQZ2 MED13-202ENST00000578132 751 ntTSL 34.88□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 44.1
UTP3Q9NQZ2 PNCK-219ENST00000463548 783 ntTSL 518.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 44.1
UTP3Q9NQZ2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 12e-6■■■■■ 44.1
UTP3Q9NQZ2 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 44.1
UTP3Q9NQZ2 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 44.1
UTP3Q9NQZ2 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 223.8■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.783e-8■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 DDX42-204ENST00000577940 1427 ntTSL 58.78□□□□□ -13e-8■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 DDX42-218ENST00000584261 510 ntTSL 37.12□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-231ENST00000557433 1904 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 215.2■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-229ENST00000557348 1659 ntTSL 213.47□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-207ENST00000553837 2152 ntTSL 513.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 44
UTP3Q9NQZ2 INTS11-242ENST00000531377 816 ntTSL 518.49■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 HBS1L-214ENST00000529641 881 ntTSL 59.41□□□□□ -0.96e-12■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.186e-12■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 HBS1L-213ENST00000529169 633 ntTSL 37.16□□□□□ -1.266e-12■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-219ENST00000636033 1940 ntTSL 522.88■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-216ENST00000635944 1960 ntTSL 519.65■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-239ENST00000636920 1989 ntTSL 518.99■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-217ENST00000635998 1845 ntTSL 518.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-233ENST00000636701 2158 ntTSL 518.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 43.9
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