Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAX2Q9UIW0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms