Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PPP1R26-AS1-202ENST00000603624 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-13■■■■■ 276.5
UTP3Q9NQZ2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 276.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.586e-9■■■■■ 276.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 276.2
UTP3Q9NQZ2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.717e-8■■■■■ 276.1
UTP3Q9NQZ2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 275.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 221.41■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 275.3
UTP3Q9NQZ2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 275.3
UTP3Q9NQZ2 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 275.3
UTP3Q9NQZ2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 275.1
UTP3Q9NQZ2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 275.1
UTP3Q9NQZ2 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 275.1
UTP3Q9NQZ2 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 275.1
UTP3Q9NQZ2 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 275.1
UTP3Q9NQZ2 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 521.12■□□□□ 0.976e-9■■■■■ 274.8
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-215ENST00000573927 778 ntTSL 317.09■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 274.8
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-209ENST00000496698 561 ntTSL 49.91□□□□□ -0.829e-9■■■■■ 274.4
UTP3Q9NQZ2 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 273.6
UTP3Q9NQZ2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 273.5
UTP3Q9NQZ2 CTIF-207ENST00000589585 564 ntTSL 414.7□□□□□ -0.065e-14■■■■■ 273.4
UTP3Q9NQZ2 ETFA-206ENST00000559075 1735 ntTSL 223.25■■□□□ 1.313e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-201ENST00000267950 1289 ntTSL 523.02■■□□□ 1.283e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-215ENST00000560595 917 ntTSL 1 (best)21.92■■□□□ 1.13e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.963e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 STK40-205ENST00000460017 511 ntTSL 520.58■□□□□ 0.893e-16■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-211ENST00000560044 1054 ntTSL 519.65■□□□□ 0.743e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-218ENST00000560899 910 ntTSL 518.31■□□□□ 0.523e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 418.25■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ECD-204ENST00000453402 884 ntTSL 217.38■□□□□ 0.371e-17■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 417.3■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ECD-202ENST00000413026 877 ntTSL 314.33□□□□□ -0.121e-17■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 SIK3-202ENST00000413553 3054 ntTSL 59.52□□□□□ -0.894e-12■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ASNSP1-202ENST00000641079 1352 ntBASIC9.48□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ASNSP1-203ENST00000641735 1372 nt9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-18■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-18■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-217ENST00000560816 412 ntTSL 38.21□□□□□ -1.13e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ETFA-210ENST00000559973 804 ntTSL 38.17□□□□□ -1.13e-32■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 SIK3-213ENST00000497049 715 ntTSL 57.54□□□□□ -1.24e-12■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ECD-208ENST00000610256 581 ntTSL 57.47□□□□□ -1.211e-17■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.93□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-18■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.02□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 273.3
UTP3Q9NQZ2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.68e-12■■■■■ 272.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP17-215ENST00000575283 2213 ntTSL 214.34□□□□□ -0.118e-12■■■■■ 272.8
UTP3Q9NQZ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.824e-8■■■■■ 272.7
UTP3Q9NQZ2 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 222.34■■□□□ 1.176e-7■■■■■ 272.5
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 272.5
UTP3Q9NQZ2 GCFC2-204ENST00000442309 642 ntTSL 522.2■■□□□ 1.143e-9■■■■■ 272.3
UTP3Q9NQZ2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.873e-9■■■■■ 272.3
UTP3Q9NQZ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 272.2
UTP3Q9NQZ2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 272.2
UTP3Q9NQZ2 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 272.2
UTP3Q9NQZ2 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 272.2
UTP3Q9NQZ2 ADCK1-208ENST00000557501 844 ntTSL 319.3■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 272.1
UTP3Q9NQZ2 ADCK1-203ENST00000393639 1225 ntTSL 216.92■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 272.1
UTP3Q9NQZ2 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 272.1
UTP3Q9NQZ2 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 272.1
UTP3Q9NQZ2 GAS6-204ENST00000608763 2646 nt20.57■□□□□ 0.883e-36■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 PPARA-206ENST00000440343 368 ntTSL 1 (best)28.84■■■□□ 2.218e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.248e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 SARM1-201ENST00000379061 1921 ntTSL 220.81■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 INPP5A-207ENST00000498337 565 ntTSL 319.06■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 PPARA-204ENST00000415785 531 ntTSL 417.16■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 PPARA-205ENST00000420804 572 ntTSL 215.26■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 514.08□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 NSMCE2-201ENST00000287437 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.68e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 NSMCE2-203ENST00000517532 841 ntTSL 510.01□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 HDAC8-216ENST00000470998 329 ntTSL 36.24□□□□□ -1.418e-7■■■■■ 271.7
UTP3Q9NQZ2 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.284e-13■■■■■ 271.6
UTP3Q9NQZ2 ESYT1-205ENST00000550179 576 ntTSL 46□□□□□ -1.455e-9■■■■■ 271.6
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-209ENST00000588857 1555 ntTSL 1 (best)24■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 271.5
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 271.5
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-204ENST00000586417 1752 ntTSL 222.04■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 271.5
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-208ENST00000588667 1619 ntTSL 1 (best)21.5■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 271.5
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-211ENST00000589753 931 ntTSL 1 (best)16.32■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 271.5
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC7-205ENST00000481507 903 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 271.2
UTP3Q9NQZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.692e-10■■■■■ 271.1
UTP3Q9NQZ2 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)23.46■■□□□ 1.352e-10■■■■■ 271.1
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-210ENST00000486303 708 ntTSL 221.33■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 271.1
UTP3Q9NQZ2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.942e-10■■■■■ 271.1
UTP3Q9NQZ2 JUP-207ENST00000437369 586 ntTSL 312.31□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 270.8
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 321.64■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 270.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-225ENST00000480435 560 ntTSL 56.31□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 270.5
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-216ENST00000497909 773 ntTSL 314.3□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 270.2
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-217ENST00000498670 791 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 270.2
UTP3Q9NQZ2 CPNE1-226ENST00000486021 506 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 270.2
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 270.1
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