Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms