Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPTEP56180 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPTEP56180 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPTEP56180 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPTEP56180 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms