Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms