Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PLEKHM1-207ENST00000581448 3292 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.216e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 PNKP-228ENST00000637325 100 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.356e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 UTP3-201ENST00000254803 2073 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.46e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.86e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 SDCCAG8-211ENST00000497459 525 ntTSL 213.84□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 TMEM62-202ENST00000563859 1540 ntTSL 213.8□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 23.1
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