Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHDC2Q9Y2U9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms