Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYO6Q9UM54 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYO6Q9UM54 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms